1. 干细胞和生殖生物学研究领域 

　　面向生命科学前沿和国家在人口健康领域的重大需求，依托“干细胞与再生医学创新研究院”和“干细胞与生殖生物学国家重点实验室”，建设国际一流的科研设施、平台和装置，并积极建议和参与国家实验室建设，提出引领性的国际重大科学计划和工程；围绕影响国民健康的重大疾病，重点解决生命发生、发育和修复的重大科学问题，研发干细胞与再生医学新技术、开发干细胞相关新产品，建立干细胞防治重大疾病的新策略。力争在减数分裂，生殖细胞发生与再生，生殖健康研究，器官发生、发育、功能维持与重建，干细胞的小分子药物筛选，重大疾病机制及疾病动物模型创制等优势领域取得原创性重大突破和转化应用，引领我国干细胞和生殖生物学相关领域的生物医药产业，推动经济和社会发展。 

　　系统化解析细胞命运调控、胚胎发育和生殖过程的机制，建立获得功能细胞的关键技术，有效实现神经修复、生殖功能重建和重要器官制造；凝聚一批高水平的创新人才，建立一支敢于挑战前沿科学问题、能够攻克瓶颈技术、善于推动科技转化的现代化科研队伍；培养有全球化视野，在政治、经济、社会、文化等各方面知识全面，兼具管理才能的战略科学家，为国家科技发展方向和科技政策提供战略咨询；建设国际一流、国内引领的“干细胞与再生医学创新研究院”，并积极建设国家实验室，提出引领性的国际重大科学计划和工程。 

　　2. 膜生物学与重大疾病研究领域 

　　面向国家重大战略和我国人民健康需求，依托于膜生物学国家重点实验室，重点研究生物膜、细胞器及其重要分子在物质交换、能量转换与信号转导中的作用、生物膜与神经退行性疾病、肿瘤、免疫性疾病、遗传病等重大疾病的发病机理与防治、生物膜与动物发育基本规律及其关键分子调控。着力打造生物化学、分子生物学、细胞生物学、生理学与生物物理学等交叉学科平台，在已取得成绩的基础上，在钙信号、线粒体自由基和跨膜信号转导等研究领域形成了一定特色和优势。“十三五”期间，在生物膜、细胞器与重大疾病、细胞表观遗传调控与人类健康、细胞代谢与疾病、免疫领域与重大疾病领域重点引进国际科技领军人才和青年才俊，完善学科和梯队建设，初步形成具有国际水准的面向人类重大疾病的膜生物学和发育生物学研究基地，在重要领域取得引领性的优势和成果。 

　　3. 生物灾害爆发机制与控制研究领域 

　　以害虫害鼠整合生物学与绿色防控为主线，以我国重大的农业与人类健康相关的害虫、害鼠为研究对象，以解决害虫害鼠成灾的关键基础科学问题和研发可持续控制的新技术为主要目标。面向世界科技前沿，突出宏观与微观生物学相结合的研究特色，揭示害虫害鼠功能基因、分子进化、环境适应、化学通讯机制与暴发成灾规律，全面提升我国害虫害鼠研究的国际竞争力和自主创新能力，使本所成为国际一流的虫害鼠害调控机制与综合治理研究中心；面向国家重大需求和国民经济主战场，研发昆虫病毒、昆虫天敌、害虫害鼠信息素和不育剂等无公害、绿色、低碳控制技术，建立全球变化下重大害虫害鼠监测预警体系，做好先导性技术储备，为我国粮食安全、食品安全、人类健康和生态安全做出贡献，建设国际一流的“生物互作卓越中心”。 

　　4. 物种濒危机制与保护研究领域 

　　紧密围绕珍稀濒危动物就地和迁地保护中的重大科学问题，应用动物行为学、生态学、生理学、遗传学和基因组学等理论与方法，加强野生动物的监测，特别是我国特有珍稀濒危动物的保护生物学问题，研究动物濒危和灭绝机制，提出拯救和保护珍稀濒危动物的措施、方案和技术，为野生动物保护与管理和履行《生物多样性公约》及《濒危野生动植物种国际贸易公约》等提供理论基础和技术支撑。 

　　5. 物种形成与多样性维持机制研究领域 

　　进一步巩固和加强在动物分类学方面的领先地位，继续发挥引领作用。以动物系统学及进化生物学领域的关键基础科学问题为目标，加强对生物多样性的认识，重建物种及种上阶元的系统发育关系，探讨重要功能性状分化与动物演化规律，研究物种形成、协同进化及生态适应的进化机制，解析生物多样性的分布格局及形成机制，探讨全球环境变化对物种演化及多样性格局的影响，为野生动物及入侵种鉴定等国家重大需求提供理论指导、数据支撑和科学咨询。